1920年8月15日恩波利队正式成立，1983年更名为恩波利FC队一直沿用至今。此前该队曾参加过4次意甲联赛，1986-87赛季该队首次参加意甲联赛，并在该赛季以23分保级成功，1987-88赛季因在上赛季打假球被足协扣除5分，最终以最后一名降入乙级联赛，此后该队掉入丙级联赛深渊近7个赛季。1996-97赛季重返乙级联赛，次年升入甲级。1997-98赛季以积37分保级成功，但次年便再度跌入乙级联赛，经过三个赛季的卧薪尝胆，该队本赛季得以第5次获得参加甲级联赛机会。